近日,中(zhōng)國工(gōng)程院院士、廣東省科學院微生(shēng)物(wù)研究所名譽所長吳清平團隊完成了白(bái)肉靈芝的全基因組測序。據悉,這是世界上首次對白(bái)肉靈芝的基因組進行組裝和注釋。相關研究發表于《G3:基因,基因組,遺傳學》。
白(bái)肉靈芝是在中(zhōng)國發現的靈芝科一(yī)新種,具有多種藥理活性。作爲我(wǒ)國具有鮮明地域特色的野生(shēng)資(zī)源,白(bái)肉靈芝目前已成爲科技扶貧和帶動一(yī)方經濟發展的重要資(zī)源,在中(zhōng)國西南(nán)地區廣泛種植。但由于缺乏參考基因組,其遺傳研究受到了阻礙。
研究人員(yuán)從一(yī)個單核菌株中(zhōng)提取了高質量的DNA,并基于Illumina和Nanopore平台組裝完成第一(yī)個白(bái)肉靈芝全基因組。組裝的基因組大(dà)小(xiǎo)爲50.05Mb,N50爲3.06Mb,預測到78206條編碼序列和13390個基因。
此外(wài),研究人員(yuán)分(fēn)析了白(bái)肉靈芝和靈芝之間次級代謝産物(wù)(萜類化合物(wù))的功能基因的差異。研究發現,與靈芝相比,白(bái)肉靈芝具有更多與萜類化合物(wù)合成相關的基因,這可能是它們表現出不同生(shēng)物(wù)活性的原因之一(yī)。
據吳清平團隊成員(yuán)胡惠萍介紹,白(bái)肉靈芝基因組是目前組裝質量最好的靈芝屬物(wù)種。該成果爲今後特定物(wù)種的高原适應性深層研究奠定了基礎。
文章來源:中(zhōng)國科學報 作者:朱漢斌 李誠斌